原子发行版与常规发行版不同，整个基础系统以单一镜像形式交付，更新整体替换而非逐包安装，系统难以损坏，回滚方便，也不存在依赖地狱。代价是灵活性降低，无法像传统发行版那样随意改动系统包。

stillOS 默认采用 GNOME 桌面，但改为类似 Windows 11 的任务栏优先界面，支持桌面图标拖放，右键菜单可新建文件夹和文档。文件管理器打开后显示统一的「计算机」页面，整合文件夹、磁盘和可移动介质。

预装应用包括 ONLYOFFICE、Gear Lever、Warp、Mousam 等。系统自带多款 still 品牌工具：stillTerminal 终端基于定制 ZSH，支持容器和 SSH；stillCenter 应用商店聚合 Flatpak 等来源，带 stillRating 兼容性评分；stillControl 提供 12 种以上 GNOME 布局预设。社区论坛以 SWAI 网页应用形式集成到桌面。

文档新建快捷键仅支持 docx、pptx、xlsx 三种格式，安装 LibreOffice 并移除 ONLYOFFICE 后快捷键仍生成原格式，只是改用 LibreOffice 打开。