武肺Omicron的嚴重性,感染性和免疫抗性
#omicron #感染性 #免疫抗性 #嚴重性
先簡單說結論,在現行的文獻中,Omicron變種的嚴重性是有所減弱的.死亡率和ICU加護率都是其他變種的四分一,但感染年紀有所下降.感染年紀的下降也許和其感染性的增加有關.
感染性主要取決於兩點,一是病毒S蛋白上的RBD和人類接受器ACE2之間的附著性,二是啟動S蛋白的步驟,也就是用於啟動S蛋白的裂解點和人類蛋白酶之間的適合性.Omicron上有3個突變位於裂解點,15個突變位於RBD.RBD和ACE2之間的附著性,可以用它們之間的BFE結合自由能來表示.BFE越高,附著性越高.Omicron的RBD的15個突變中,12個可以提高BFE,即使是會降低BFE的3個突變中,也可能提高其免疫抗性,如E484A和Y505H.附圖有標示這些突變對BFE的影響,而現在較流行的變種中,Omicron的RBD和ACE2之間的BFE是最高的.文獻提出Omicron的感染力或許是原種武肺病毒的10倍,Delta的2.8倍.
在免疫抗性方面,武肺RBD大體上有185個氨基酸位置可以和不同的抗體連結,而Omicron的RBD上的突變令其和這些氨基酸位置間的連結都有減弱,也就是說這些氨基酸位置和抗體之間的BFE降低了.而越多氨基酸和抗體之間BFE顯著降低,抗體的作用就越低.和Delta相比時,Omicron的RBD上BFE顯著降低的氨基酸數目是Delta的兩到三倍,這顯示Omicron有更高的能力逃脫疫苗和病人自身抗體.套用到現實情況就是很多接種了疫苗的病人都被感染了.
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先簡單說結論,在現行的文獻中,Omicron變種的嚴重性是有所減弱的.死亡率和ICU加護率都是其他變種的四分一,但感染年紀有所下降.感染年紀的下降也許和其感染性的增加有關.
感染性主要取決於兩點,一是病毒S蛋白上的RBD和人類接受器ACE2之間的附著性,二是啟動S蛋白的步驟,也就是用於啟動S蛋白的裂解點和人類蛋白酶之間的適合性.Omicron上有3個突變位於裂解點,15個突變位於RBD.RBD和ACE2之間的附著性,可以用它們之間的BFE結合自由能來表示.BFE越高,附著性越高.Omicron的RBD的15個突變中,12個可以提高BFE,即使是會降低BFE的3個突變中,也可能提高其免疫抗性,如E484A和Y505H.附圖有標示這些突變對BFE的影響,而現在較流行的變種中,Omicron的RBD和ACE2之間的BFE是最高的.文獻提出Omicron的感染力或許是原種武肺病毒的10倍,Delta的2.8倍.
在免疫抗性方面,武肺RBD大體上有185個氨基酸位置可以和不同的抗體連結,而Omicron的RBD上的突變令其和這些氨基酸位置間的連結都有減弱,也就是說這些氨基酸位置和抗體之間的BFE降低了.而越多氨基酸和抗體之間BFE顯著降低,抗體的作用就越低.和Delta相比時,Omicron的RBD上BFE顯著降低的氨基酸數目是Delta的兩到三倍,這顯示Omicron有更高的能力逃脫疫苗和病人自身抗體.套用到現實情況就是很多接種了疫苗的病人都被感染了.
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